采用芬顿处理RO浓水的运行成本<2元/m³,包括电费0.22元/m³、药剂费1.56元/m³、膜折旧费用0.17元/m³。排放的芬顿污泥可以通过资源化途径加以利用，相比目前RO浓水的其他处理技术，特别是常用的蒸发结晶等零排放技术，成本有较大幅度的降低。

    膜污染控制是运行操作的关键。铁泥中存在大量不溶性的金属氧化物以及吸附的无机物和有机物，有很强的膜结垢和污染倾向。因此，膜污染的监控是运维过程中一个长期而艰巨的任务。一旦发现膜出现严重污染的迹象，要及时采取措施，避免不可逆膜污染的发生。

    系统pH值的控制是决定系统处理效果关键因素之一。运行中应定期对在线pH仪进行清洗维护，保证监测数据的准确性。芬顿试剂的投加量是另一关键因素。经验表明，可通过观察膜出水的色度（取膜出水调p H值至9～10，观察产生絮状物的颜色和量），并结合反应池混合液的pH值、颜色等定性判断投加量是否合适。

    采用了物美价廉的中空纤维超滤膜用于固液分离，但是，由于芬顿的强氧化性，以有机聚合物为材料的超滤膜是否可以耐受残留的芬顿试剂是个极大的挑战，否则将严重影响膜的使用寿命。为了应对这个问题，一是选用了以聚偏氟乙烯（PVDF）为材料通过热致相工艺（TIPS）制成的超滤膜,二是采用在线ORP仪嘉庆工艺的控制。